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1.脫氫酶活性指標法

微生物對有機物的氧化分解是在各種酶的參與下完成的，其中脫氫酶起著重要的作用：催化氫從被氧化的物質轉移到另一物質。由于脫氫酶對毒物的作用非常敏感，當有毒物存在時，它的活性(單位時間內活化氫的能力)下降。因此，可以利用脫氫酶活性作為評價微生物分解污染物能力的指標：如果在以某種廢水(有機污染物)為基質的培養液中生長的微生物脫氫酶的活性增加，則表明微生物能夠降解該種廢水(有機污染物)。

2.三磷酸腺苷(ATP)指標法

微生物對污染物的氧化降解過程，實際上是能量代謝過程，微生物產能能力的大小直接反映其活性的高低。三磷酸腺苷(ATP)是微生物細胞中貯存能量的物質，因而可通過測定細胞中ATP的水平來反映微生物的活性程度，并作為評價微生物降解有機污染物能力的指標，如果在以某種廢水(有機污染物)為基質的培養液中生長的微生物ATP的活性增加，則表明微生物能夠降解該種廢水(有機污染物)。

此外，微生物生理指標法還有細菌標準平板計數、DNA測定法、INT測定法、發光細菌光強測定法等。

雖然目前脫氫酶活性、ATP等測定都已有較成熟的方法，但由于這些參數的測定對儀器和藥品的要求較高，操作也較復雜，因此目前微生物生理指標法主要還是用于單一有機污染物的生物可降解性和生態毒性的判定。

模擬實驗法

模擬實驗法是指直接通過模擬實際廢水處理過程來判斷廢水生物處理可行性的方法。根據模擬過程與實際過程的近似程度，可以大致分為培養液測定法和模擬生化反應器法。

1.培養液測定法

培養液測定法又稱搖床試驗法，具體操作方法是：在一系列三角瓶內裝入某種污染物(或廢水)為碳源的培養液，加入適當N、P等營養物質，調節pH值，然后向瓶內接種一種或多種微生物(或經馴化的活性污泥)，將三角瓶置于搖床上進行振蕩，模擬實際好氧處理過程，在一定階段內連續監測三角瓶內培養液物理外觀(濃度、顏色、嗅味等)上的變化，微生物(菌種、生物量及生物相等)的變化以及培養液各項指標：pH、COD或某污染物濃度的變化。

2.模擬生化反應器法

模擬生化反應器法是在模型生化反應器(如曝氣池模型)中進行的，通過在生化模型中模擬實際污水處理設施(如曝氣池)的反應條件，如：MLSS濃度、溫度、DO、F/M比等，來預測各種廢水在污水處理設施中的去除效果，及其各種因素對生物處理的影響。

由于模擬實驗法采用的微生物、廢水與實際過程相同，而且生化反應條件也接近實際值，從水處理研究的角度來講，相當于實際處理工藝的小試研究，各種實際出現的影響因素都可以在實驗過程中體現，避免了其他判定方法在實驗過程中出現的誤差，且由于實驗條件和反應空間更接近于實際情況，因此模擬實驗法與培養液測定法相比，能夠更準確地說明廢水生物處理的可行性。

但正是由于該種判定方法針對性過強，各種廢水間的測定結果沒有可比性，因此不容易形成一套系統的理論，而且小試過程的判定結果在實際放大過程中也可能造成一定的誤差。

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