全基因組甲基化測序技術(WGBS)可以在全基因組范圍內檢測所有單個胞嘧啶堿基(C堿基)的甲基化水平。能為基因組DNA甲基化時空特異性修飾的研究提供重要技術服務,能廣泛應用在個體發育、衰老和疾病等生命過程的機制研究中,也是各物種甲基化圖譜研究的優選方法。可應用于稀有樣本,如胚胎細胞、腫瘤干細胞等的全基因組甲基化研究。
全基因組甲基化測序技術(WGBS)常規起始量WGBS:運用約1微克的基因組DNA進行文庫構建和重亞硫酸鹽處理。可根據物種基因組大小和測序數據量增加構建文庫的個數,減少測序bias,確保甲基化檢測的準確性。
數據解讀分析內容
1.數據產出、過濾和質控
。下機數據過濾和質控圖表
2.數據比對、甲基化信息
。比對結果、Bisulfite轉化率統計
。覆蓋度以及覆蓋深度統計
。甲基化修飾位點及水平結果
3.甲基化修飾特征 .
。甲基化修飾位點和水平的特征及統計
4.差異甲基化修飾區域
。差異甲基化修飾區域(DMR)的鑒定和注釋
5.差異甲基化修飾基因
。差異甲基化修飾基因功能和通路分析
樣本要求
- 樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
- 樣品需求量:≥2μg;
- 樣品濃度:≥30 ng/μl;
- 樣品純度:OD260/280=1.8~2.0