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研究相互蛋白質(zhì)的作用

2016-06-28 10:14:26上海邦景實(shí)業(yè)有限公司點(diǎn)擊量：319

ELISA試劑盒研究人員開發(fā)出一種新技術(shù)，可以將細(xì)胞內(nèi)的DNA條形碼拼接在一起，以同時(shí)搜尋數(shù)百萬(wàn)個(gè)蛋白質(zhì)配對(duì)，用以分析蛋白質(zhì)相互作用。

DNA條碼技術(shù)使得科學(xué)家們能夠進(jìn)行高度并行的實(shí)驗(yàn)，在實(shí)驗(yàn)中，許多不同類型的細(xì)胞可以在同一試管中進(jìn)行測(cè)試。新一代DNA測(cè)序進(jìn)一步使得這一切成為可能，其可以有效地計(jì)算條形碼，并“讀出”結(jié)果。然而，可以組合在同一試管內(nèi)的實(shí)驗(yàn)的數(shù)量，往往因編碼細(xì)胞的類型而受到限制。能夠讓條形碼在細(xì)胞內(nèi)融合在一起，意味著科學(xué)家現(xiàn)在可以打破這個(gè)障礙。這一新技術(shù)，可以相同的價(jià)格，使研究人員探索發(fā)現(xiàn)的速度提高10倍。

使用DNA條形碼，用于多路復(fù)用實(shí)驗(yàn)，一直是一種非常強(qiáng)大的技術(shù)。不過(guò)，一直都是在單維空間上，在某種意義上，我們只能每個(gè)條形碼讀取一次實(shí)驗(yàn)。通過(guò)結(jié)合細(xì)胞內(nèi)的條形碼，我們可以大大提高可以結(jié)合在同一試管內(nèi)的實(shí)驗(yàn)的數(shù)量。

在一種廣泛使用的方法（稱為酵母雙雜交，Y2H）中，攜帶一個(gè)“誘餌”蛋白的酵母細(xì)胞，與攜帶一個(gè)“獵物”蛋白的酵母細(xì)胞雜交。Y2H系統(tǒng)是可操縱的，因此，只有細(xì)胞中的“誘餌”蛋白和“獵物”蛋白質(zhì)粘在一起，細(xì)胞才能生存，這使得科學(xué)家可以觀察到，蛋白質(zhì)與其他蛋白質(zhì)之間的相互作用。研究團(tuán)隊(duì)將他們的新技術(shù)命名為Barcode Fusion Genetics-Yeast Two Hybrid (BFG-Y2H)。在BFG-Y2H中，攜帶數(shù)千個(gè)“誘餌”蛋白和“獵物”蛋白的細(xì)胞，在相同的培養(yǎng)物中雜交。為了確保每個(gè)蛋白質(zhì)配對(duì)被檢測(cè)用于發(fā)現(xiàn)相互作用，這個(gè)過(guò)程確保每一個(gè)細(xì)胞類型與所有其他細(xì)胞類型雜交。

蛋白質(zhì)，可單獨(dú)工作，或以較大的集群工作，是執(zhí)行一個(gè)細(xì)胞許多作用的機(jī)械。作者說(shuō)，更定位蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)，可以擴(kuò)大人員對(duì)于“我們的細(xì)胞是如何工作的”的理解，并揭示只發(fā)生在一定環(huán)境條件下的蛋白質(zhì)相互作用。

BFG-Y2H方法的新穎性在于，細(xì)胞被編程為，可將來(lái)自“誘餌”細(xì)胞和“獵物”細(xì)胞的DNA條形碼，連接進(jìn)一個(gè)“融合條形碼”。然后，使用新一代DNA測(cè)序方法，檢測(cè)融合的條形碼——與粘在一起的“誘餌”蛋白和“獵物”蛋白組合對(duì)應(yīng)。

在一個(gè)瓶?jī)?nèi)，可以檢測(cè)到數(shù)百萬(wàn)個(gè)蛋白質(zhì)配對(duì)，用于發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)相互作用，因此，一名研究人員在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)，能夠在不到兩周時(shí)間內(nèi)并行測(cè)試到幾十種情況。

這項(xiàng)研究的*目標(biāo)是，生成蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的一段‘3D視頻’，而不是一個(gè)靜態(tài)的畫面。BFG-Y2H方法通過(guò)有效地生成更加富含信息的蛋白質(zhì)相互作用圖，將加速我們對(duì)于基因功能和人類疾病的理解。

ELISA試劑盒

 

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