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甲醇酵母表達系統(tǒng)有不少優(yōu)點,其中以Invitrogen公司的Pichia酵母表達系統(tǒng)zui為人熟知,并廣泛應用于外源蛋白的表達。雖然說酵母表達操作簡單表達量高,但是在實際操作中,并不是每個外源基因都能順利得到高表達的。不少人在操作中會遇到這樣那樣的問題,收集了部分用戶在使用EasySelect Pichia Expression System這個被譽為zui簡單的畢赤酵母表達的經(jīng)典試劑盒過程中的心得體會。其中Xiang Yang是來自美國喬治城大學(Georgetown University)Lombardi癌癥中心(Lombardi Cancer Center),部分用戶來自國內(nèi)。
甲基酵母部分優(yōu)點 | 與其他真核表達系統(tǒng)比較 | 與原核表達系統(tǒng)比較 |
1.屬于真核表達系統(tǒng),具有一定的蛋白質(zhì)翻譯后加工,有利于真核蛋白的表達優(yōu)點 | - | + |
2.AOX強效啟動子,外源基因產(chǎn)物表達量高,可以達到每升數(shù)克表達產(chǎn)物的水平 | +++ | + |
3.酵母培養(yǎng)、轉(zhuǎn)化、高密度發(fā)酵等操作接近原核生物,遠較真核系統(tǒng)簡單,非常適合大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn)。 | +++ | = |
4.可以誘導表達,也可以分泌表達,便于產(chǎn)物純化。 | = | + |
5.可以甲醇代替IPTG作為誘導物,部分甲醇酵母更可以甲醇等工業(yè)產(chǎn)物替代葡萄糖作為碳源,生產(chǎn)成本低 | +++ | + |
+ 表示優(yōu)勝于;- 表示不如;= 表示差不多
EasySelect Pichia Expression System
產(chǎn)品性能:
優(yōu)點――使用簡單,表達量高,His-tag便于純化
缺點――酵母表達蛋白有時會出現(xiàn)蛋白切割問題
全面產(chǎn)品報告及心得體會:
巴斯德畢赤酵母(Pichia pastoris)是一種能表達重組蛋白的酵母品種,一方面由于其是屬于真核生物,因此表達出來的蛋白可以進行糖基化修飾,另一方面畢赤酵母生長速度快,可以將表達的蛋白分泌到培養(yǎng)基中,方便蛋白純化。
畢赤酵母表達載體pPICZ在多克隆位點(MCR)3'端帶有his-tag和c-myc epitopes,這些tag有利于常規(guī)檢測和純化,而且在MCR5'端引入了alpha factor(α-factor)用以增加表達,并且在表達后α-factor可以自動被切除。在進行克隆的時候,如果你選擇的是EcoRI,那么只需在目標蛋白中增加兩個氨基酸序列即可完成。另外pPICZ系列選用的是Zeocin抗生素作為篩選標記,而誘導表達的載體需要甲醇――甲醇比一般用于大腸桿菌表達誘導使用的IPTG便宜。
*步――構(gòu)建載體
Xiang Yang:pPICZ系列有許多克隆位點可供選擇,同時也有三種讀碼框以便不用的用戶需要。
紅葉山莊:有關是選擇pPIC9K還是pPICZ系列?pPIC9K屬于穿梭質(zhì)粒,也可以在原核表達,而pPICZ系列比較容易操作,大腸和畢赤酵母均用 抗Zeocin篩選(PIC9K操作麻煩一點,大腸用amp抗性,而畢赤酵母先用His缺陷篩選陽性克隆,在利用G418篩選多拷貝),而且對于大小合適(30―50KD)的蛋白在產(chǎn)量上是pPIC9K*的。
leslie:要做畢赤酵母表達實驗,首先當然就要了解這個可愛的酵母了(橢圓形,肥嘟嘟的,十分可愛),她和大腸桿菌長得有較大區(qū)別(大腸桿菌是桿狀的),因此在培養(yǎng)的過程中要區(qū)別這兩種菌體,除了氣味,濃度,顏色以外,也可以取樣到顯微鏡中觀測。大家做畢赤表達的時候應該都遇過這種情況吧,表達過程中染菌(我們實驗室曾經(jīng)污染過各種顏色形狀的細菌,那真是一段可怕的經(jīng)歷),如果在不知情的情況下繼續(xù)做下去,那可以就是浪費大把的時間了。
基本熟悉了畢赤酵母,了解了她生長的喜好(多糖偏酸環(huán)境),生長的周期等等情況后,當然更多的精力還是應該花在表達的目的蛋白上,我的表達蛋白有些恐怖,有100KD,本來當然應該放在大腸桿菌中表達,但是為了分泌表達(其實后來發(fā)現(xiàn)大腸桿菌pET系列分泌表達系列也不錯)和糖基化修飾(主要是這個方面,因為我的蛋白是人源的,表達出來用于酵母雙雜,因此需要有完備的糖基化修飾)。這樣我的DNA片段由于較長,所以在做克隆的時候也要非常小心,需要注意的是:
①酶切位點不能出現(xiàn)在目的DNA段中――如果片段長無法避免,可以采用平末端連接;
②雖然α-factor可以自動切除,但是在設計表達的時候,如果在N端不能出現(xiàn)任何多余的aa(比如藥物蛋白表達),需要特別留意(說明書上有詳細說明:P13);
③有三種不同的讀碼框(對于pPICZα系列來說就是對上α-factor序列),在設計克隆的時候要反復確定自己的讀碼框是否正確,這可是致命的問題;
④無論pPICZ還是pPICZα都有TGA(終止密碼子),但是pPICZ系列沒有ATG(起始密碼子),有人認為酵母啟動子與外源基因的ATG之間的距離越短對于表達的該基因越有利;
⑤如果不希望有c-myc和His-tag,可以在基因片段末尾加入終止密碼子;
⑥Pichia的密碼子與釀酒酵母的相似,有關基因表達偏好密碼子的問題有人認為沒有必要更換,有人認為一定要換,個人認為以產(chǎn)量為主要目的的可以考慮更換基因密碼子,而如果片段過長就比較麻煩,不過有許多真核保守蛋白其實是和酵母密碼子相似的;
⑦克隆菌株需要有recA,endA,試劑盒帶有的*0挺好用的(其它像是DH5α都行),但是要注意帶有篩選抗生素Zeocin的培養(yǎng)基要用低鹽培養(yǎng)基(NaCl減半),這主要是因為怕影響到抗生素作用(Zeocin平板要避光保存);
⑧測序引物可以用α-factor信號引物,也可以用5'AOX1引物;
⑨如果需要高量表達,可以考慮做克隆的時候串聯(lián)基因片段進行表達,另外也可以在轉(zhuǎn)化酵母的時候重復轉(zhuǎn)化。
⑩目的基因中不要含有pro-glu-ser-thr這樣的序列,因為這個序列是激活蛋白水解酶的作用底物,會影響表達,另外也不要含有x-phe-x-arg-gln和gln-arg-x-phe-x這樣的序列(x=任何氨基酸),因為這些序列容易受到容酶體的切割,而且目的蛋白末端是ala,asp,val,ser這樣的氨基酸。除此之外許多高A+T含量的基因通常會由于提前終止而不能有效轉(zhuǎn)錄,也需要多加注意。
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