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注意事項:RNA抽提指南(TRIZOL)

時間:2015/11/12閱讀:547
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注意事項:
* 全程佩戴一次性手套。皮膚經常帶有細菌和霉菌,可能污染RNA的抽提并成為RNA酶的來源。培養良好的微生物實驗操作習慣預防微生物污染。
* 使用滅菌的,一次性的塑料器皿和自動吸管抽提RNA,避免使用公共儀器所導致的RNA酶交叉污染。例如,使用RNA探針的實驗室可能用rna酶a 或T1來降低濾紙上的背景,因而某些非一次性的物品(如自動吸管)可能富含RNA酶。
* 在TRIZOL 中,RNA 是隔離在RNA 酶污染之外的。而對樣品的后續操作會要求用無RNA 酶的非一次性的玻璃器皿或塑料器皿。玻璃器皿可以在150°C 的烘箱中烘烤4 小時。塑料器皿可以在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鐘,用水*漂洗干凈后高壓滅菌備用。
抽提步驟:
1.勻漿化作用
通過離心來沉淀細胞后,棄上清,用移液管加TRIZOL試劑反復吹打來裂解細胞至均一通亮的液態后,將勻漿樣品在15—30°C 條件下孵育5 分鐘以使核蛋白體*分解。
(每5—10×106的動物細胞,植物或酵母菌細胞或每1×107 細菌加1ml的TRIZOL。在加入TRIZOL前應避免洗滌細胞因為那樣會增加mRNA降解的可能性。)
2.分離階段
每1 mlTRIZOL 加0.2 ml 氯仿。蓋緊樣品管蓋,用手用力搖晃試管15 秒并將其在30°C 下孵育2—3 分鐘。在2—8°C 下以不超過12,000×g 的離心力高速冷凍離心15 分鐘。離心后混合物分成三層:下層紅色的苯酚-氯仿層,中間層,上層無色的水樣層。RNA 無一例外地存在于水樣層當中。水樣層的容量大約為所加TRIZOL 容量的60%
3.RNA的沉淀
將水樣層轉移到一干凈的試管中,通過將水樣層和異丙醇混合來沉淀RNA。zui初均化時的每1 mlTRIZOL 對應0.5 ml 異丙醇。將混合的樣品在15—30°C 條件下孵育10 分鐘并在2—8°C 下以不超過12,000×g 的離心力高速冷凍離心10 分鐘。RNA沉淀在離心前通常不可見,形成一膠狀片狀沉淀附著于試管壁和管底。(如果希望分離DNA 和蛋白,有機層同樣要予以保留。在除去水樣層后,樣品中的DNA 和蛋白也能相繼以沉淀的方式還原。乙醇沉淀能析出中間層的DNA,在有機層中加入異丙醇能沉淀出蛋白。共純化DNA 對于樣品間標準化RNA 的產量十分有用。)
4.RNA的洗脫
移去上層懸液。用75%的乙醇洗滌RNA 沉淀一次,每1 ml 的TRIZOL 至少加1 ml 的75%乙醇。旋渦振蕩混合樣品并在2—8°C 下以不超過7,500×g的離心力高速冷凍離心5 分鐘。
5.RNA的再溶解
在操作的zui后,簡單干燥RNA沉淀。尤為重要的是,不能讓RNA沉淀*干燥那樣會極大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA樣品其A 260/280 比值< 1.6。用移液管尖分幾次移取無RNA酶的水或0.5% SDS溶液來溶解RNA,并在55—60°C下孵育10 分鐘。

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