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一、 目的及要求。
1、 了解質(zhì)粒作為載體在基因工程中的作用
2、 熟記提取質(zhì)粒的基本原理,學習提取過程和方法
3、 為下一步實驗提供高純度的DNA 樣品
二、原理:
1、 質(zhì)粒(Plasmid):獨立于染色體以外的雙鏈、閉合、環(huán)狀DNA,可自我復制。為基因工程中的常用載體(Vector)
2、 作為載體的質(zhì)粒需具備以下特點:
1) 能自主復制。
2) 具有多個限制性內(nèi)切酶的單一酶切位點,又稱為多克隆位點(multiple cloning sites, MCS),便于外源基因的插入。
3) 具有1 個以上的篩選標記(抗性基因)。
4) 分子量相對較小,多拷貝。
5) 非結(jié)合性質(zhì)粒。
6) 轉(zhuǎn)化效率高。
* 目前已有一系列符合上述要求的質(zhì)粒作為商品供應。
3、 大腸桿菌中提取純化質(zhì)粒的主要步驟:
1) 細菌的培養(yǎng):LB 培養(yǎng)基+氨芐青霉素O.D600=0.4 對數(shù)生長期 O.D600=0.6 對數(shù)生長后期
2)細菌的收集和裂解
收集:離心,STE 液洗1-2 次,去除代謝物
裂解:SDS 法、堿裂解法、煮沸法
堿裂解法:EDTA 破壞細菌的細胞壁和細胞外膜→SDS 裂解細胞膜→NaOH 使核酸、蛋白質(zhì)變性。
3)質(zhì)粒的分離和純化
加入酸液,質(zhì)粒DNA、小分子RNA 復性(可溶),染色體DNA、高分子量RNA、K+/SDS/蛋白質(zhì)/膜復合
物沉淀,離心棄除;酚:氯仿抽提去除蛋白質(zhì);RNAse去除殘留小分子RNA……。
三、試劑:
略
四、操作:
1. 將0.2ml 含重組質(zhì)粒pIL 的大腸桿菌接種于2.5ml LB 培養(yǎng)基(含Amp 100ug/ml)中,37℃、150rpm 振蕩培養(yǎng)過夜。作用:加Amp 的目的為使含Amp 抗性基因的細菌選擇性生長。
2. 取1.5ml 菌液置于1.5ml EP 管中,15,000rpm 離心30 秒,棄上清,將培養(yǎng)液盡量控干。
作用:沉淀細菌。注意:控干時將吸水紙卷成圓柱狀,沿管壁輕輕吸取水珠。控干時不要觸及細菌沉淀。
3. 加入1ml STE 溶液,漩渦振蕩器上振蕩懸菌,15,000rpm 離心5min,棄上清,控干。
作用:去除培養(yǎng)基中殘留的細菌代謝物。
4. 加入100ul 溶液Ⅰ,震蕩懸菌,室溫放置5min。
作用:Glucose--增加溶液粘度,保護DNA;Tris-HCl--緩沖液;
EDTA--螯合二價陽離子,抑制核酸酶,預處理細菌。注意:在渦振蕩器上震蕩懸菌。
5. 加入200ul 溶液Ⅱ,輕輕顛倒混勻5 次,置冰浴5min。
作用:SDS--去污劑,使細胞裂解;NaOH--變性劑,使蛋白質(zhì)、核酸變性。注意:此時溶液呈膠胨狀,嚴格控制混勻次數(shù)和變性時間。
6. 加入150ul 溶液Ⅲ,顛倒混勻,置冰浴10min。
作用:酸液,中和NaOH,使質(zhì)粒DNA、小分子RNA 復性(可溶),染色體DNA、高分子量RNA、K+/SDS/蛋白質(zhì)/膜復合物不能復性而沉淀
注意:此時溶液出現(xiàn)大量絮狀沉淀
7. 15,000rpm 離心5min,將上清400ul 轉(zhuǎn)移至另一干凈EP 管中,棄沉淀。
注意:將槍頭插入溶液中央吸取,不要將沉淀吸出,用吸水紙擦拭槍頭。
8. 加入240ul 異丙醇(0.6 體積),混勻,置室溫10min。
作用:沉淀核酸(DNA、大分子rRNA、mRNA)和蛋白質(zhì)。
9. 15,000rpm 離心10min,棄上清,控干。
10. 50ul TE 溶解沉淀,加入50ul 冰預冷的5M LiCl,混勻,置冰浴10min。
作用:使大分子大分子rRNA、mRNA 沉淀,而DNA 不沉淀。
11. 15,000rpm 離心10min,上清100ul 轉(zhuǎn)移至另一EP 管中。
12. 加2 倍體積-20℃預冷的無水乙醇,混勻,-20℃沉淀10min。
13. 15,000rpm 離心10min,棄上清。
14. 待乙醇揮發(fā)后,將沉淀溶于20ul TE。將質(zhì)粒DNA 溶液置于-20℃ 保存。
五、注意事項:
1. 嚴格控制堿變性的時間時間,不超過5 分鐘。因為,如質(zhì)粒處于強堿性環(huán)境中時間過長,可發(fā)生不可逆變性,導致限制性內(nèi)切酶切割困難。
2. 在加入溶液III 后,要充分混勻并置冰上。如未見大量白色沉淀,說明實驗失敗,應立即重做。
3. 棄上清時,必須控干即除盡管內(nèi)的液體,在做zui后一步時,應盡量將乙醇揮發(fā)干凈,因為如殘留較多乙醇,以后在做酶切鑒定時,乙醇會使限制性內(nèi)切酶失活。但此步的時間不宜過長,一般在10-15 分鐘左右,可用濾紙條小心吸凈離心管壁上的乙醇液滴以節(jié)省時間。
六、思考題:
1. 簡要說明作為基因工程的載體,質(zhì)粒必須具備哪些特點。
2. 簡要說明質(zhì)粒提取的3 個步驟及其原理。
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