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1. oligo DNA是以OD260單位來計算的,這是指在1ml體積1cm光程標準比色皿中,260nm波長下吸光度為1A260的Oligo溶液定義為1 OD260單位,根據此定義,1 OD260單位相當于33μg的Oligo DNA,您可以根據此數據和您的Oligo DNA分子量,計算得到摩爾數以計算不同摩爾濃度的溶液。
2. 引物序列的分子量計算公式如下:
MW=(A堿基數×312)+(C堿基數×288)+(G堿基數×328)+(T堿基數×303)-61
例如:引物TGGGCGGCGGTTGGTGTTACG A=1 C=3 G=11 T=6
MW=(1×312)+(3×328)+(6×303)-61=6541
3. Oligo DNA的分子量也可以用以下近似方法計算:Oligo DNA中的每個脫氧核苷酸堿基的平均分子量近似為324.5,則一條Oligo DNA的分子量=堿基數×324.5。
例:您得到一管標為5 OD260的20 mer Oligo DNA
分子量=20×324.5=6490
質量數=5×33=165μg
摩爾數=165/6490=0.025μmol=25nmol
若加滅菌雙蒸水400μl溶解,則濃度為25nmol/400μl=62.5μM
4. 裝有引物的eppendorf管一般保存于-20℃,臨用前稀釋。
5. 由于Oligo DNA呈很輕的干膜狀附在管壁上,打開時極易散失,所以打開管子前請先離心10,000rpm,1min,然后再慢慢打開管蓋。
6. 在裝有引物的eppendorf管內加入100-500μl雙蒸水,蓋上管蓋,充分上下振蕩5-10分鐘,再次離心10,000rpm,1min。
7. 計算原引物管primer的濃度(必要時測OD260核對廠家提供引物量是否正確)。
8. 計算并將應用primer稀釋為10pmol/μl。
9. 標明原引物管、應用引物管、稀釋方法,置-20℃保存。
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