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研究闡述血液中細胞特異性的DNA甲基化改變

時間:2020-11-20閱讀:370
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近期,中國科學院上海營養與健康研究所(中國科學院-馬克斯·普朗克科學促進學會計算生物學伙伴研究所)研究員Andrew Teschendorff課題組與研究員汪思佳課題組合作

吸煙是一些復雜疾病的主要危險因素。表觀遺傳改變,特別是DNA甲基化(DNAm)的改變,被認為在提高疾病發生風險過程中發揮重要作用。大量已有的表觀基因組關聯研究(EWAS)通過繪制血液中DNAm改變的圖譜,探究吸煙如何影響正常細胞DNA甲基化。然而,血液由多種不同類型的細胞組成,因此,學界尚不清楚哪些特定的細胞類型更可能受到吸煙的影響。

研究團隊*通過細胞特異性的方式對血液EWAS進行Meta分析以解決該問題。研究人員收集并分析來自7個獨立EWAS隊列的DNA甲基化數據,其中包括對吸煙相關DNAm變化進行全面分析的中國隊列。研究發現,與吸煙有關的DNAm變化在很大程度上與種族無關,佐證將多種族隊列合并進行Meta分析的合理性。Meta分析進一步揭示血液中大多數吸煙相關的DNAm變化如何在骨髓細胞系內發生,且主要出現在炎性單核細胞和巨噬細胞的DNase超敏位點上。新發現的與吸煙相關的髓樣特異性DNAm信號與急性髓系白血病相關,吸煙是急性髓細胞白血病的中度危險因素,然而,在淋巴細胞系內未發現太多與吸煙相關的DNAm改變

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