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普通老百姓關心蔬菜、大米里重金屬有沒有超標,而研究人員們關心的事情,還包括怎么監(jiān)測重金屬污染、怎么修復被重金屬污染的土壤。
在銅污染對洋蔥根毒害的細胞學效應基礎上,應用蛋白質組學(Proteomics)研究技術,成功鑒定出32個跟重金屬毒害高度相關的蛋白。
也就是說,這32個蛋白是植物抵抗重金屬和受到重金屬損傷zui重要的標識之一,這一成果對揭示植物重金屬毒害的早期分子響應具有重要理論意義。
但是這32個蛋白到底是什么,沒有背景研究可供參考。雖然洋蔥根尖是觀察細胞有絲分裂的經典材料,但研究人員對它的遺傳背景研究幾乎是空白,沒有人對它進行過全基因組測序。
于是,他們摸索出一個方法:利用D N A和蛋白質之間的產物———R N A來作為背景數(shù)據庫。轉錄組測序比全基因組測序工作量要小得多,而且研究成本也大大降低。
先是對洋蔥進行了高通量轉錄組測序,建立了相應的洋蔥虛擬蛋白質數(shù)據庫(含24305條氨基酸序列信息)。
然后再把這32個蛋白的數(shù)據提交到這個數(shù)據庫,鑒定出重金屬C u污染誘導的27個差異表達蛋白,包括植物防御反應、細胞壁(cell wall)合成、細胞周期和D N A復制、轉錄調控與蛋白質合成等相關蛋白。
更重要的是,找到了12條代謝通路,包含8萬多個基因,這是一個重要的理論基礎,相當于給以后的研究畫了一個草圖,為植物對重金屬響應的分子機制(Molecular Mechanisms)研究奠定堅實基礎。
這個發(fā)現(xiàn)未來將應用于抗重金屬作物分子育種。李韶山解釋,該研究成功鑒定的蛋白有可能作為生物工程改造的靶向位點,以提高農作物對重金屬污染的對抗性,或降低有害重金屬在農產品中的累集。