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新一代強終止子

閱讀:414發布時間:2013-11-14

 

終止子是能使mRNA脫離RNA聚合酶和模板DNA的短序列。基因的啟動,需要可誘導的強啟動子,而基因的關閉則需要可靠的終止子。基因工程在很大程度上依賴基因轉錄的有效啟動和終止。

目前,大型基因工程設計面臨的問題是,只有三四種終止子序列可供使用。如果在復雜系統中重復使用同樣的終止子序列,這些元件就會因為同源重組而消失。

麻省理工MIT的研究人員構建了包括582個大腸桿菌終止子在內的文庫,這些終止子有些是天然存在的,有些是人工合成的。他們在文庫中鑒定得到了近四十個強終止子序列,這些序列抑制下游基因表達超過50倍,并且不易于受到重組的影響。隨后,研究人員對這些終止子序列進行了分析,得出了終止子構建的優化規律。

文章作者之一,MIT的副教授Christopher Voigt在進行復雜基因工程設計時,發現同源重組是自己面臨的一大障礙。“這項研究為大型基因工程設計,提供了更廣泛的選擇,”Voigt說。

研究團隊將終止子放在兩個熒光報告基因之間,并對兩個報告基因的表達水平進行檢測,以此衡量終止子的可靠性。如果只有*個基因得到表達,意味著這個終止子很強。如果兩個基因都表達,則意味著二者之間是弱終止子。

研究人員發現,影響終止子效果的主要有三個因素:發夾式莖環結構、莖環下游緊接U-tract、莖環上游富含A的區域。研究顯示,強終止子的序列容易快速形成發夾結構,但終止子強度與這種莖環結構本身的強度無關。研究人員將這些參數,整合到終止子強度的新熱力學模型中。

研究人員還指出,構建強終止子的辦法是,從天然終止子中選取*片段,并將其以新的方式裝配起來。“

  


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