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中國(guó)蓮基因組測(cè)序完成

閱讀：237發(fā)布時(shí)間：2013-11-28


    蓮屬包含中國(guó)蓮和美洲蓮兩個(gè)種，前者廣泛分布于我國(guó)、印度、日本等亞洲國(guó)家，后者主要分布于北美洲和加勒比海。我國(guó)是世界蓮花起源和種植中心之一，早在7000多年前的河姆渡文化遺址中就發(fā)現(xiàn)蓮的遺跡。目前，蓮是我國(guó)重要的水生經(jīng)濟(jì)作物，栽培面積超過

該團(tuán)隊(duì)成員明瑞與李紹華確定對(duì)蓮花進(jìn)行基因組測(cè)序。測(cè)序項(xiàng)目從2011年3月開始啟動(dòng)，主要的測(cè)序和后續(xù)拼接、分析工作到2012年上半年均已完成。與投資巨大、周期長(zhǎng)的水稻、人類基因組項(xiàng)目相比，蓮基因組項(xiàng)目耗時(shí)較短、花費(fèi)zui少。
   “蓮基因組的成功測(cè)序標(biāo)志著水生植物、水生經(jīng)濟(jì)作物的研究進(jìn)入基因組學(xué)時(shí)代。”武漢植物園助理研究員王魯表示。
    王魯介紹說，該研究為功能基因組學(xué)、發(fā)掘新基因提供了序列和基因資源。此前由于沒有基因組序列，也沒有序列背景比較清楚的近緣物種，因而蓮的新基因發(fā)掘進(jìn)展異常緩慢。蓮基因組草圖從多個(gè)方面將大大促進(jìn)新基因克隆。
    其次，基因組測(cè)序便于遺傳作圖、促進(jìn)蓮分子育種。王魯認(rèn)為，蓮基因組序列的公布將有助于科學(xué)家深入研究蓮特異的生物學(xué)特征，包含荷葉表面結(jié)構(gòu)、荷花的生熱作用及種子千年不死的長(zhǎng)壽秘密等。擁有了蓮基因組序列，能大大加速新基因的挖掘。
    在比較基因?qū)W和進(jìn)化學(xué)方面，研究人員通過蓮基因組中存在的各種生物進(jìn)化的“蛛絲馬跡”，結(jié)合其他物種的類似證據(jù)，整理出被子植物的進(jìn)化脈絡(luò)。同時(shí)，蓮基因組測(cè)序項(xiàng)目結(jié)束了水生被子植物沒有全基因組組裝序列的歷史，將促進(jìn)水生經(jīng)濟(jì)作物育種進(jìn)入新的發(fā)展時(shí)期。
    韓月澎介紹說，為了面向生產(chǎn)，培育蓮栽培品種，發(fā)展相關(guān)的種植技術(shù)，蓮功能基因組學(xué)和分子育種學(xué)的研究將在武漢植物園深入進(jìn)行下去。“和傳統(tǒng)的常規(guī)育種相比，基于基因組序列的分子育種將在各方面產(chǎn)生推動(dòng)作用。”
    王魯也認(rèn)為，利用蓮基因組項(xiàng)目提供的海量SNP信息，可進(jìn)一步研發(fā)高密度SNP芯片，進(jìn)而開發(fā)全基因組選擇育種芯片，這將大大提高育種的選擇效率。

 


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