通過直接測定的方法，發現植物的根部有合成生長素的能力[11].研究證實，大多數的生長素還是在生長旺盛的幼嫩葉片或子葉中合成的，之后通過韌皮部快速運輸到植物的根等部位[12].生長素在植物體內的運輸主要有兩種形式，一是快速的，與其他代謝產物一起以集束流（mass flow）的形式通過成熟維管束組織進行的被動運輸，這種運輸不需要消耗能量，無固定方向；二是慢速的，單方向、在細胞之間進行的依賴于載體來完成的運輸，這種運輸發生在維管束形成層和韌皮部薄壁細胞，稱為極性運輸（polar auxin transport,PAT）[13 -14].生長素極性運輸是一種主動運輸，具有幾個顯著的特點，一是廣泛存在于高等植物體內，二是可被一些化學物質如 1-萘氨甲酰苯甲酸（NPA）、2,3,5-三碘苯甲酸（TIBA） 等所抑制[15],導致發生一些異常現象，如花芽形成被抑制等，三是需要輸出載體 PIN和輸入載體 AUX/LAX[16 -17].對生長素極性運輸調控花發育的研究依賴于相關突變體的研究。PIN1 編碼一種參與到生長素輸出的跨膜蛋白[18 - 19],對 pin1 突變體植株的研究發現，該種突變體表現出花發育的缺陷性[20 - 21],在整個花序發育的過程中表現出多向性的缺陷，并且不能開花，表明生長素是花原基起始的基本條件。
但是，阻斷生長素的極性運輸卻不能夠抑制植株從營養生長向生殖生長的轉換，即使是 pin1 突變體植株也能夠產生花序，而植株由花序分生組織向花分生組織發育的過程中是需要正常的生長素運輸的[22],對正常的植株施用生長素運輸抑制劑也不能夠抑制其開花。對此，Cheng 等人[23]認為，對植株施用 NPA 等生長素極性運輸抑制劑阻斷生長素的極性運輸并不能夠改變整個植株的生長素水平，只對局部的生長素濃度梯度有影響。
對擬南芥另外一種突變體 pinoid 的研究也有相似的結果，兩種突變體的花芽發育都受到了抑制，并且在花序發育上和 pin1 突變體植株相似。而 PINOID 編碼一種參與到生長素極性運輸的*/*蛋白激酶，這為生長素極性運輸對花芽發育的調控提供了有力的證據。
張憲省等[24]報導了生長素運輸對蘭花子房發育的作用，作者將 NAA（Naphthaleneacetic acid）施用于蘭花，與未處理的對照組相比，經 NAA 處理的蘭花子房發育要優于對照組。同時，又進行了NPA 施用試驗，作者將 NPA 和 NAA 混合施用，發現花粉柱和花被與授粉后的表現一致，但子房的生長受到了抑制，并且該種抑制效果隨著 NPA 的濃度降低而減弱直至消失，這表明生長素運輸受抑制的程度與子房發育的程度成負相關，生長素運輸所受抑制程度越高，子房發育越緩慢，這表明授粉后子房的發育需要通過生長素的極性運輸轉運來的生 長 素。對 毛 白 楊 （ Populus tomentosa carr） 中PtAUX1 的過量表達對子房發育的影響試驗結果也證實了生長素極性運輸對花發育的作用[25].PtAUX1 的作用是在毛白楊中合成生長素輸入載體。將 PtAUX1 導入到正常的毛白楊中是其表達量高于正常水平，觀察到在導入 4 -5 周后，子房會在芽周圍聚集形成類似于花序的結構，不同于野生型的毛白楊雌花，這種結構不會形成杯狀的苞片，并且也與野生型的會聚集成柔荑花序的情況有所差異。這種異常的情況表明了受 PtAUX1 的表達水平影響的生長素極性運輸對子房發育的調控作用。elisa試劑盒
MtPIN10 的作用是在蒺藜狀苜蓿 （ Medicagotruncatula）中合成生長素運輸載體，Peng & Chen[26]對 MtPIN10 研究發現，（MtPIN1-MtPIN10）編碼的蛋白與擬南芥中（PIN1-PIN8）編碼的蛋白序列進行對比發現，MtPIN10 和擬南芥中的 pin1 基因編碼的蛋白有 65% 的相同序列，并且二者都有一個結構相似的內含子 - 外顯子結構，因此，MtPIN10和pin1 屬于功能性同源，并且 MtPIN10 突變體和 pin1突變體會呈現出相似的三子葉、四子葉或二者混合的異常性狀。而在 pin1 突變的擬南芥中，植株表現出了花序發育等過程中的明顯缺陷。因此，作者推測在生長素運輸載體合成不足的缺陷型蒺藜狀苜蓿中同樣會表現出花發育上的缺陷。作者的研究也證實了這一點，同時也發現了二者的區別。擬南芥 pin1 突變體表現出因缺少側身器官而不能夠產生花序分生組織，與之對比的MtPIN10突變體則是能產生異常的花序組織和花器，突變體是不育的。不僅如此，作者還發現了突變體中其他一些異常情況。例如，在正常的蒺藜狀苜蓿中，一個花柄上產生1 ~3 朵花，而在 MtPIN10 突變體中，一個花柄上可以產生 10 朵花，并且與正常植株的花朵形成的封閉結構不同的是，突變體的花朵會形成類似于提早成熟的花朵形成的開放式結構。這表明抑制生長素極性運輸會導致花發育出現異常。
花形成的過程主要有四個步驟：從營養生長向生殖生長的過渡，花序分生組織的形成，花分生組織的形成和花器的形成。Oka 等人[27]對擬南芥IAApin 突變體植株的研究發現，突變體植株產生了異常的花序，對其籽苗施用不同濃度的 NAA 或者 2,4-D 并不能夠讓其花序恢復正常，產生正常的花朵。對于轉入了吲哚乙酰胺水解酶基因的 pin突變體植株，其體內的游離態生長素水平要遠低于正常植株，結合態的生長素含量則比正常植株高，而表現型也與 pin 突變體植株類似即不能夠開花或花序軸上的花朵異常。對該種轉基因突變體植株內的生長素運輸情況研究發現，轉基因 pin 植株花序軸頂部和基部的生長素運輸水平遠低于野生型植株，甚至比 pin 的還要低。而對這兩種突變體植株施用外源的吲哚乙酰胺后，兩種突變體植株的花序表型并不能夠恢復至野生型，表明增加內源生長素的含量并不能對突變體花序軸中的生長素極性運輸產生影響。作者推測，生長素極性運輸的變化對突變體植株的花序發育的影響要大于其含量變化所產生的影響。elisa試劑盒
Orlova 等人[28]報道了轉基因矮牽牛花中因苯甲酸合成的減少而導致了花發育的異常情況。他們發現，轉基因的矮牽牛花有比野生型更大的花粉，并且花粉釋放的時期也較晚。而苯甲酸的合成對生長素的極性運輸有著影響[29].于是，為了驗證苯甲酸合成減少導致的生長素運輸變化情況，他們采用了放射性同位素標記的方法，發現生長素從頂端合成部位向根冠過渡區的運輸量比野生型有了明顯的提高。作者推測由于內源苯甲酸合成量的變化導致的生長素極性運輸水平的改變促使了花發育水平的異常情況的發生。
