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艾美捷m6A RNA甲基化片段富集試劑盒用途和相關(guān)研究方案

時(shí)間:2023/1/3閱讀:131
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用途:

艾美捷m6A RNA甲基化片段富集試劑盒旨在富集RNA含有來自低輸入RNAm6A的片段,并通過PCR或譜鑒定區(qū)域特異性m6A通過使用Illumina平臺或其他方法進(jìn)行下一代測序,獲得表轉(zhuǎn)錄體寬度m6A。該套件的創(chuàng)新工作原理、優(yōu)化方案和組件允許捕獲m6A片段具有最小的非特異性背景水平。富集的RNA適合于快速構(gòu)建非條形碼(單路)和條形碼(多路)庫,允許m6A區(qū)域以較小的偏差和高分辨率被映射。

 

輸入量:

通常情況下,每個(gè)反應(yīng)的總RNA量范圍為1µg20µg。對于最佳制備,輸入量應(yīng)為10µg RNA,但數(shù)據(jù)可從使用該試劑盒,總RNA低至500ng。

 

起始材料:

起始材料可以包括各種哺乳動物細(xì)胞樣品,如培養(yǎng)物來自燒瓶或平板的細(xì)胞、從血液、體液和新鮮/冷凍組織、從整個(gè)細(xì)胞群和胚胎細(xì)胞中分選的特定細(xì)胞等。

 

目前,有幾種方法用于表轉(zhuǎn)錄體范圍的m6A映射。這些方法包括MeRIP、PA-m6A-seq、miCLIPm6A CLIP。MeRIP已被廣泛使用,但無法實(shí)現(xiàn)m6A剖面中的高分辨率。PA-m6A-seq、miCLIPm6A CLIP提高了剖面分辨率但再現(xiàn)性差,工藝復(fù)雜。特別是,這些方法耗時(shí)(>2天)且成本高昂。為了解決這些問題,EpigenTek開發(fā)了一種新方法:切割并運(yùn)行M6A富集(在靶下切割并使用核酸酶回收M6A富集)。

 

艾美捷m6A RNA甲基化片段富集試劑盒組分:

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抗體:

艾美捷m6A RNA甲基化片段富集試劑盒中使用的抗m6A兔多克隆抗體對m6A具有高度特異性RNA片段,MeRIP級,不與腺嘌呤非甲基化RNA片段交叉反應(yīng)。

 

內(nèi)部控制:

本試劑盒中提供了陽性對照。

 

注意事項(xiàng):

為避免交叉污染,小心地將樣品或溶液移到試紙條中井。使用氣溶膠屏障移液管吸頭,并始終在液體轉(zhuǎn)移之間更換移液管的吸頭。穿在整個(gè)過程中戴手套。如果手套與樣品接觸,更換手套立即。

 

m6A RNA甲基化片段富集試劑盒相關(guān)研究:

RNA甲基化定量

P-9003甲基安培™ RNA二硫化物轉(zhuǎn)化試劑盒

P-9005 EpiQuik™ m6A RNA甲基化定量試劑盒(比色法)

P-9008 EpiQuik™ m6A RNA甲基化定量試劑盒(熒光法)

P-9010甲基閃光™ m6A DNA甲基化ELISA試劑盒(比色法)

P-9015甲基閃光™ 尿N6甲基腺苷(m6A)定量試劑盒(比色法)

P-9016 EpiNext™ 切割和運(yùn)行RNA m6A序列試劑盒

DNA分離和清理

P-1003裝配放大器™ 普通組織切片DNA分離試劑盒

P-1004裝配放大器™ 血漿/血清DNA分離試劑盒

P-1006 DNA濃縮試劑盒

P-1009裝配放大器™ 石蠟組織切片DNA分離試劑盒

P-1017裝配放大器™ 尿液DNA分離試劑盒

P-1018裝配放大器™ 血液和培養(yǎng)細(xì)胞DNA提取試劑盒

DNA富集反應(yīng)

P-1015甲基安培™ 甲基化DNA捕獲(MeDIP)試劑盒

P-1038 EpiQuik™ 羥甲基化DNA免疫沉淀(hMeDIP)試劑盒

P-1052 EpiQuik™ MeDIP Ultra套件

P-2002 EpiQuik™ 染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)試劑盒

P-2003 EpiQuik™ 組織染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)試劑盒

2014年上半年EpiQuik™ 工廠ChIP套件

P-2025 ChromaFlash™ 一步ChIP套件

P-2026 ChromaFlash™ 一步磁性ChIP套件

P-2027 ChromaFlash™ ChIP Ultra套件

P-2030 EpiNext™ ChIP Seq高靈敏度試劑盒

PCR分析

P-1029 EpiQuik™ 定量PCR試劑盒

DNA文庫準(zhǔn)備

P-1051 EpiNext™ DNA文庫制備試劑盒(Illumina

P-1053 EpiNext™ 高靈敏度DNA文庫制備試劑盒(Illumina

NGS條形碼

P-1060 EpiNext™ NGS條形碼(索引)集-12


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