污染源在線監測系統是一種環境監測內容，主要用環境監測手段確定污染物的排放來源、排放濃度、污染物種類等，為控制污染源排放和環境影響評價提供依據，同時也是解決污染糾紛的主要依據。
隨著信息化技術的不斷發展，現代化的污染源在線監測除了要考慮到監測的實時性、數據的可靠性、報警的及時性、對現場端設備的遠程控制等主要功能外，還需與地理信息系統相結合，起到總攬全局的效果。同時，還需要具備工整規范的數據報表、有效的數據對比分析等功能。因此，設計現代化的污染源在線監測對提升污染源監測能力是十分必要的。
污染源在線監測系統主要是監測下面這兩大塊：
1、廢水方面：工業污水與生活污水混合后集中處理的均須有氨氮、磷酸鹽監測項目；紡織行業中無印染工藝的可不安裝氨氮監測儀，有印染工藝的且使用分散染料的氨氮日排量較少(一般15公斤以下)的可不安裝氨氮監測儀；化工行業的氨氮、磷酸鹽項目應視該企業的排放情況確定，有排放則須安裝監測裝置；制革行業中具有鞣革工藝的企業須應安裝氨氮監測儀。
2、廢氣方面：重點檢查火電熱電企業CEMS監測系統。查看是否有顆粒物、SO2、NOx、流速、溫度、含氧量、煙道壓力、濕度監測系統，如不需要安裝、是否向環保部門備案。煙氣流速儀是否安裝在煙囪上，流速儀安裝是否規范，安裝在煙道上的流速儀檢測裝置是否具有代表性；檢查采樣預處理系統，采樣伴熱管、采樣探頭是否加熱，是否具備過濾系統；檢查系統采樣探頭，伴熱管，皮托管、煙塵分析系統是否具備自動反吹清洗功能。另外，水泥廠應在窯尾安裝煙塵、SO2、NOx及流量等測定儀，在窯頭安裝煙塵、流量等測定儀。
污染源在線監測系統是在完成安裝、調試及試運行，并和環境保護主管部門聯網后，應進行建設驗收、儀器設備驗收、聯網驗收及運行與維護方案驗收。
