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　有機(jī)化學(xué)起源于19世紀(jì)初，一般認(rèn)為，物理化學(xué)作為一門(mén)學(xué)科的正式形成，是從1877年德國(guó)化學(xué)家?jiàn)W斯特瓦爾德和荷蘭化學(xué)家范托夫創(chuàng)刊的《物理化學(xué)雜志》開(kāi)始的。而物理有機(jī)化學(xué)是依據(jù)物理化學(xué)的基本原理來(lái)詮釋、探討有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)與反應(yīng)機(jī)理，并歸納法則及發(fā)展新說(shuō)的一門(mén)科學(xué)，它的發(fā)展是在建立在有機(jī)化學(xué)和物理化學(xué)發(fā)展的基礎(chǔ)上的，因此它是一門(mén)比較年輕的學(xué)科。物理有機(jī)化學(xué)的研究可以追溯到 20世紀(jì)初，但到30年代才成為一門(mén)獨(dú)立的分支學(xué)科，但除了在 60年代曾一度躋身有機(jī)化學(xué)之主流外，多年來(lái)其相關(guān)研究都不是化學(xué)研究的熱門(mén)課題。我國(guó)物理有機(jī)化學(xué)研究起步于 60年代，70年代后期以來(lái)得到發(fā)展， 主要研究成果基本上是在 80年代以來(lái)取得的。

　　20世紀(jì)物理有機(jī)化學(xué)的發(fā)展經(jīng)歷了一個(gè)漫長(zhǎng)的過(guò)程。從J.Stiegliz發(fā)表關(guān)于碳陽(yáng)離子的文章到卡賓中間體的發(fā)現(xiàn)，再到 1914年W.Schlenk和E.Marcus發(fā)現(xiàn)帶陰電荷的中間體，人們開(kāi)始了對(duì)物理有機(jī)化學(xué)的探索。隨著中間體的研究的深入，人們開(kāi)始著手研究涉及中間體的反應(yīng)機(jī)理，并對(duì)影響結(jié)構(gòu)一活性關(guān)系的關(guān)鍵因素如立體化學(xué)、空間效應(yīng)、取代基電子效應(yīng)等有了初步的認(rèn)識(shí)。30年代開(kāi)始物理有機(jī)化學(xué)有了很快的發(fā)展，并將有機(jī)反應(yīng)機(jī)理應(yīng)用于分析生物化學(xué)過(guò)程，開(kāi)創(chuàng)了高聚物化學(xué)。1952年，由于Wiinson和Woodward的智慧以及Fischer的工作.使二茂鐵的結(jié)構(gòu)得以闡明。這是一個(gè)重要的轉(zhuǎn)折點(diǎn)，由此帶來(lái)了金屬有機(jī)化學(xué)飛速的發(fā)展，大量的過(guò)渡金屬元素有機(jī)物被合成出來(lái)并得到廣泛的應(yīng)用。由于金屬有機(jī)化學(xué)的突出發(fā)展，在此后的20多年中有多位化學(xué)家因此獲得諾貝爾獎(jiǎng)。60年代以后，由于量子化學(xué)特別是分子軌道法用于研究有機(jī)結(jié)構(gòu)和反應(yīng)性，物理有機(jī)化學(xué)進(jìn)入了一個(gè)新的研究階段，對(duì)于有機(jī)結(jié)構(gòu)的研究直接立足于微觀結(jié)構(gòu)，而不再是由宏觀現(xiàn)象推測(cè)，研究手段由宏觀觀測(cè)向微觀觀測(cè)發(fā)展，研究方法由靜態(tài)向動(dòng)態(tài)發(fā)展。