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土壤呼吸是碳素由陸地生態系統返回大氣的主要途徑，也是土壤中生命活動的表征，準確測定其釋放量是評價生態系統中生物學過程的關鍵。通過對土壤呼吸及其相關參數的監測，可估測根系和土壤微生物對氣候變化的響應。
土壤呼吸的嚴格意義是指未擾動土壤中產生二氧化碳的所有代謝作用，包括三個生物學過程，即土壤微生物呼吸、根系呼吸和土壤動物呼吸，以及一個非生物學過程，即含碳礦物質的化學氧化作用，土壤呼吸可分為自養呼吸和異養呼吸，前者指根呼吸和根際微生物呼吸，后者指土壤微生物和動物呼吸，自養型呼吸消耗的底物直接來源于植物光合作用產物向地下分配的部分，而異養型呼吸則利用土壤中的有機或無機碳，土壤呼吸強度常用于衡量土壤微生物總活性，也被用于評價土壤肥力，森林土壤呼吸是陸地生態系統土壤呼吸的重要部分，其動態變化將對全球碳平衡產生深遠的影響。
實驗室土壤呼吸測量系統推薦山東云唐，該設備加入了溫度調節的雙波長紅外二氧化碳分析器， 測量范圍：0-5000ppm，分辨率：0.1ppm； 精度3ppm。二氧化碳測量不受溫度變化影響，具有穩定、精度高，反映靈敏，1秒鐘之內就可以完成二氧化碳差值采集。
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