單細胞全基因組甲基化測序技術

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更新時間：2019-11-21 20:03:05瀏覽次數：1329次

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深圳市易基因科技有限公司

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產品簡介

單細胞全基因組甲基化測序技術（Single-cell Bisulfite Sequencing, scBS-Seq）是運用線性擴增技術，對單個細胞基因組DNA的甲基化水平進行單堿基精確檢測。分離單細胞后，將細胞用特殊的裂解液進行裂解，并直接進行重亞硫酸鹽處理進行轉換。轉換后的DNA作為模板，經隨機引物擴增后進行高通量測序，檢測全基因組的甲基化水平。

詳細介紹

單細胞全基因組甲基化測序技術（Single-cell Bisulfite Sequencing, scBS-Seq）是運用線性擴增技術，對單個細胞基因組DNA的甲基化水平進行單堿基精確檢測。分離單細胞后，將細胞用特殊的裂解液進行裂解，并直接進行重亞硫酸鹽處理進行轉換。轉換后的DNA作為模板，經隨機引物擴增后進行高通量測序，檢測全基因組的甲基化水平。該技術可應用于研究單個細胞內的基因組甲基化圖譜，對胚胎發育、腫瘤干細胞等微量或異質性細胞的甲基化研究提供有力的研究策略。

單細胞全基因組甲基化測序技術是將單細胞分離后，通過單管酶反應，將細胞裂解后的基因組DNA連接接頭，特異性的檢測單個細胞的CpG島和啟動子等區域的甲基化信息。該技術可運用于胚胎發育、腫瘤干細胞等微量或異質性細胞的甲基化研究。

微量甲基化測序是指對5-10ng的基因組DNA或片段化的DNA，進行全基因組甲基化檢測的技術。微量DNA樣本的甲基化測序技術可應用于病灶組織、FFPE樣本和cell-free DNA甲基化檢測分析。

數據解讀分析內容

基本數據處理
- 原始數據評估，去除接頭與過濾低質量數據；
- reads數量以及數據產出統計。
基礎生物學信息分析
- 將測序數據與參考基因組比對，統計比對結果；
- 基于比對結果，統計各C位點的甲基化修飾信息；
- 測序數據的堿基覆蓋深度及覆蓋度統計；
- 胞嘧啶（CG、CHG、CHH）甲基化水平統計；
- 基因組甲基化分布及修飾特征分析；
高級生物學信息分析
- 結合項目背景的差異甲基化修飾位點(DMS)的鑒定、注釋和分布分析；
- 結合項目背景的差異甲基化修飾區域(DMR)的鑒定、注釋和分布分析；
- 結合項目背景的差異甲基化修飾基因的功能、通路和疾病等富集分析；
- 結合項目背景，與其他多組學數據的關聯分析。