一、色譜圖中未出峰解決方法：系統未進樣或樣品分解；泵未輸液或流動相使用不正確；檢測器設置不正確；針對以上情況成因作相應調整即可。
二、一個峰或幾個峰是負峰。
解決方法：流動相吸收本底高；進樣過程中進入空氣；樣品組分的吸收低于流動相。
三、所有峰均為負峰。解決方法：信號電纜接反或檢測器輸出極性設置顛倒；光學裝置尚未達到平衡。
四、所有峰均為寬峰。
解決方法：系統未達到平衡；溶解樣品的溶劑極性比流動相差很多；色譜柱尺寸及類型選擇不正確；色譜柱或保護柱被
污染或柱效降低；溫度變化造成的影響。
五、所出峰比預想的小解決方法：樣品黏度過大；進樣品故障或進樣體積誤差；檢測器設置不正確．定量環體積不正確；檢測池污染；檢測器燈出現問題。
六、保留時間變化可能的原因 : 解決方法
1.柱溫變化 : 柱恒溫
2.等度與梯度間未能充分平衡 : 至少用10倍柱體積的流動相平衡柱
3.緩沖液容量不夠 : 用>25mmol/L的緩沖液
4.柱污染 : 每天沖洗柱
5.柱內條件變化 : 穩定進樣條件,調節流動相
6.柱快達到壽命 : 采用保護柱
七、保留時間縮短可能的原因 : 解決方法
1.流速增加 : 檢查泵,重新設定流速
2.樣品超載 : 降低樣品量
3.鍵合相流失 : 流動相PH值保持在3-7.5檢查柱的方向
4.流動相組成變化 : 防止流動相蒸發或沉淀
5.溫度增加 : 柱恒溫
八、保留時間延長可能的原因 : 解決方法
1.流速下降 : 管路泄漏,更換泵密封圈,排除泵內氣泡
2.硅膠柱上活性點變化 : 用流動相改性劑,如加三乙胺,或采用堿至鈍化柱
3.鍵合相流失 : 流動相PH值保持在3-7.5檢查柱的方向
4.流動相組成變化 : 防止流動相蒸發或沉淀
5.溫度降低 : 柱恒溫
九、肩峰可能的原因 : 解決方法
1.樣品體積過大 : 用流動相配樣,總的樣品體積小于峰的15%
2.樣品溶劑過強 : 采用較弱的樣品溶劑
3.柱塌陷或形成短路通道 : 更換色譜柱,采用較弱腐蝕性條件
4.柱內燒結不銹鋼失效 : 更換燒結不銹鋼,加在線過濾器,過濾樣品
5.進樣器損壞 : 更換進樣器轉子
十、鬼峰可能的原因 : 解決方法
1.進樣閥殘余峰 : 每次用后用強溶劑清洗閥,改進閥和樣品的清洗
2.樣品中未知物 : 處理樣品
3.柱未平衡 : 重新平衡柱,用流動相作樣品溶劑 (尤其是離子對色譜)
4.三(TFA)氧化(肽譜) : 每天新配,用抗氧化劑
5.水污染(反相) : 通過變化平衡時間檢查水質量，用HPLC級的水
十一、基線噪聲可能的原因 : 解決方法
1.氣泡(尖銳峰) : 流動相脫氣,加柱后背壓
2.污染(隨機噪聲) : 清洗柱,凈化樣品,用HPLC級試劑
3.檢測器燈連續噪聲 : 更換氘燈
4.電干擾(偶然噪聲) : 采用穩壓電源,檢查干擾的來源(如水浴等)
5.檢測器中有氣泡 : 流動相脫氣,加柱后背壓
十二、峰拖尾可能的原因 : 解決方法
1.柱超載 : 降低樣品量,增加柱直徑采用較高容量的固定相
2.峰干擾 : 清潔樣品,調整流動相，使用更長的色譜柱
3.硅羥基作用 加三乙胺,用堿致鈍化柱增加緩沖液或鹽的濃度降低流動相PH值,鈍化樣品
4.柱內燒結不銹鋼失效 : 更換燒結不銹鋼,加在線過濾器,過濾樣品
5.柱塌陷或形成短路通道 : 更換色譜柱,采用較弱腐蝕性條件
6.死體積或柱外體積過大 : 連接點降至,對所有連接點作合適調整,盡可能采用細內徑的連接管
7.柱效下降 : 用較低腐蝕條件,更換柱,采用保護柱，活化色譜柱
十三、峰展寬可能的原因 : 解決方法
1.進樣體積過大 : 用流動相配樣,總的樣品體積小于峰的15%
2.在進樣閥中造成峰擴展 : 進樣前后排出氣泡以降低擴散
3.數據系統采樣速率太慢 : 設定速率應是每峰大于10點
4.檢測器時間常數過大 : 設定時間常數為感興趣峰半寬的10%
5.流動相粘度過高 : 增加柱溫,采用低粘度流動相
6.檢測池體積過大 : 用小體積池,卸下熱交換器
7.保留時間過長 : 等度洗脫時增加溶劑含量也可用梯度洗脫
8.柱外體積過大 : 將連接管徑和連接管長度降至最小
9.樣品過載 : 進小濃度小體積樣品
十四、峰分叉可能的原因：解決方法
1.保護柱或分析柱污染：取下保護柱再進行分析。如果必要更換保護柱。如果分析柱阻塞，拆下來清洗。如果問題仍然存在，可能是柱子被強保留物質污染，運用適當的再生措施。如果問題仍然存在，入口可能被阻塞，更換篩板或更換色譜柱。
2. 樣品溶劑不溶于流動相：改變樣品溶劑。如果可能采取流動相作為樣品溶劑。
十五、基線漂移可能的原因:解決方法
1、柱溫波動。（即使是很小的溫度變化都會引起基線的波動。通常影響示差檢測器、電導檢測器、較低靈敏度的紫外檢測器或其它光電類檢測器）：控制好柱子和流動相的溫度，在檢測器之前使用熱交換器
