iScan芯片掃描系統
該系統的核心是iScan 閱讀器，它包含了高性能的激光器，光學儀器及其檢測系統。iScan 閱讀器能夠提供亞微米分辨率和非匹配的數據輸出率。甚至是密度的芯片亦可在幾分鐘內進行掃描，每天可以處理多達96個多樣品芯片。
·這些成像特性尤其有利于進行高密度基因型分型，CNV分析，DNA甲基化和基因表達分析。
·該掃描系統支持各種多樣品芯片格式的infinium、GoldenGate,DASL,基因表達（直系雜交）和甲基化分析
該掃描系統包括一個能控制所有掃描器的計算機工作站。這個自動化系統提供激光控制，精密力學控制（包括焦點馬達），激發信號檢測，圖像注冊，圖像收集及數據輸出。數據分析由GenomeStudio軟件提供支持。該軟件是一種易使用的可視化工具，具有*的數據控制能力和廣泛的數據輸出能力。
·該掃描閱讀器是建立在LIMS（實驗室信息管理系統）上，并可自動選擇分析追蹤流線樣品以及對大規模項目進行工作流程管理。
·AutoLoader 2.x可被加入到單或雙掃描系統從而能每天高通量輸出成千上萬的樣品數據。
流程和規格
iScan提供了流線型成像檢測流程，需要極少的用戶交互服務進行自動掃描裝置和數據處理。通過可選擇性的自動 Autoloader 2.x 和 實驗室信息管理系統可進一步提高數據輸出效率以及避免高代價的處理錯誤。
檢測/協議
BeadArray: Infinium HD, Infinium Methylation, DASL, Direct Hyb
技術參數
| iScan 技術參數 |
| 視野 | 1 mm 寬 |
| 像素分辨率 | 0.54 微米 |
| 激光激發 | 532 nm and 658 nm 雙激光激發 |
| 發射光譜 | 550-600 nm and 677-697 nm |
| 圖像登記 | 自動 |
| 數據讀取 | 自動 |
| 圖像輸出格式 | TIFF, PNG, JPG格式(壓縮或未壓縮) |
| 數據輸出格式 | IDAT (Illumina公司專有格式) |
| 檢測器模擬到數字轉換 | 16位 |
| 檢測極限 | 5 fluor/µm2 (Cy3 or Cy5) |
| 輸入電壓 | 100-240V AC 50/60 Hz, single phase |
| 輸出功率 | 3A (110V); 1.5A (220V) |
| 尺寸 | 52 cm (寬) × 45 cm (高) × 66 cm (深) |
| 重量 | 65 kg |
用戶代表評論
Sarah Murray, Ph. D.
Director of Genomic Medicine, The Scripps Research Institute
Sarah Murray博士與The Scripps Research Institute (TSRI)中開展全基因組關聯研究的研究人員合作，來鑒定心血管疾病的遺傳定子。
訪問Sarah Murray博士
Infinium HD BeadChip芯片和iScan系統在您的實驗室中表現如何?
Human610-Quad BeadChip芯片為我們帶來了非常棒的數據質量，就檢出率而言近乎完整。我們對iScan系統極為滿意。BeadArray Reader和iScan系統之間基因型檢出的一致性為99%。這種度量證明了新系統在檢出基因型方面如何優異。Human610-Quad BeadChip芯片還可以用在拷貝數變異分析上。在這方面，我們想了解Log R比值偏差。Log R是強度的衡量，人們用它來查看拷貝數變異。我們所看到的是兩種掃描儀都得到了質量很好的Log R比值差異衡量，實際上iScan系統要更好一點，因此我們非常滿意。
您認為iScan系統為研究人員提供了哪些優勢?
我想說iScan系統的是顯著降低了掃描時間。整一塊板上四塊Human610-Quad BeadChip芯片在iScan Reader中運行，每個樣品大約耗時7分鐘，相比之下BeadArray Reader中每個樣品需要大約45分鐘。我想對大多數實驗室而言，掃描時間可能是的瓶頸。降低的掃描時間以及單個Infinium HD Beadchip芯片上4個樣品的組合讓研究人員真正提高了能力和通量。
