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撫生試劑-我國桑蠶大規模基因組重測序完成

閱讀:167發布時間:2013-12-9

我國桑蠶大規模基因組重測序完成
日前,由深圳華大基因研究院與西南大學合作的研究成果《40個基因組的重測序揭示了蠶的馴化事件及馴化相關基因》在學術期刊《科學》上發表,這是兩家單位自2003年以來在家蠶基因組研究領域取得的又一項重要成果。

  據悉,這項研究共獲得40個家蠶突變品系和中國野桑蠶的全基因組序列,是多細胞真核生物大規模重測序研究的報道,共獲得632.5億對堿基序列,覆蓋了99.8%的基因組區域;繪制完成了世界上*張基因組水平上的蠶類單堿基遺傳變異圖譜,是世界上報道的昆蟲基因組變異圖;從全基因組水平上揭示了家蠶的起源進化;發現了馴化對家蠶生物學影響的基因組印記。

  華大基因的專家表示,桑蠶大規模基因組重測序和遺傳變異圖譜構建的完成,有助于從全基因組范圍研究馴化和人工選擇對家蠶生物學的影響,闡釋家蠶及野桑蠶之間生物學差異的遺傳基礎。更為重要的是,與野桑蠶相比,家蠶具有更優良的經濟性狀,本研究所發現的全基因組選擇印記,特別是那些受到強烈選擇的具體基因,對家蠶重要優勢經濟性狀相關基因克隆及其形成機理的研究至關重要。

  在不到兩個月的時間里,研究團隊即完成了該項目的全部實驗和測序工作。海量數據產出之后,深圳華大基因研究院自主搭建的超算中心及自主開發的生物信息軟件發揮了重要作用,利用超大規模計算能力,研究團隊完成了龐大的數據處理,迅速完成了數據分析和成果發表。而本次研究的40個代表性的家蠶和中國野桑蠶品系全部來自于西南大學蠶學與基因組學重點實驗室。

  團隊負責人表示,該計劃后續所有的目標都將集中在“發現基因、研究基因和利用基因”上,利用轉基因技術制作的新型蠶品種和相關產品將于近期進入人們的視野。
我國桑蠶大規模基因組重測序完成
 



 


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