人的指紋往往會有磨損，從而影響識別，甚至會出現一定比例的人群，由于其指紋的紋路較淺而無法使用指紋識別功能。此外，由于目前的指紋識別技術并不需要活體支持，因此存在被盜用的可能性，不法分子可以通過復制手指的紋理從而騙過指紋識別驗證機制，而更為忍的是，一些不法分子甚至可能直接將受害者的手指砍除以完成指紋認證。
相對指紋識別，虹膜識別除卻在紋理上更為復雜從而讓安全性與準確率大大提升外，更重要的一點是，它的驗證機制需要活體支持，這就使得不法分子通過復制虹膜紋理以通過驗證的可能性幾乎為零，此外，即使不法分子將受害者的眼睛摘除亦是無法通過驗證的。
那么指紋識別相對虹膜識別就真的一無是處了嗎?當然不是，指紋識別之所以能成為當下手機行業中zui為主流的生物識別應用，不外乎這三個原因。首先，其安全性具備一定的保證，相對傳統的密碼輸入方式，其安全性與便利性不言而喻;其次，它的實現方式在技術上而言是較為簡單的，也就是說門檻低，便于大規模地生產制造;zui后，當然是其價格較為適合了，這保證了它的加持不至于大幅度提升手機的售價了。
盡管虹膜識別在安全性及穩定性等方面的表現要比指紋識別強大得多，何以至今依然未在手機上普及開來呢?筆者以為，主要還是在于技術實現的難度以及價格，當然這兩者是相輔相成的。
正是因為虹膜紋理更為復雜的原因，這也使得虹膜識別技術在實現的過程中需要摘取更多的有效單位讀取點(如前文所言，虹膜識別一般需要摘取266個單位的讀取點，而其他的生物識別一般是13至16個)，這其實是一把刃劍，它在提升識別準確率的同時，對算法的復雜性以及執行效率提出了更高的要求，也就是說前期在軟件研發上需要投入更多的成本。此外在硬件上，它還需要攝像頭的配合以實現對虹膜影像的采集及提取。
事實上，正是這些在軟硬件上龐大的資源投入，使得其價格在相對指紋識別上的優勢蕩然無存，應該說虹膜識別技術的實現已非難事，難的是在手機這么小巧的機身上加載，并將其控制在合理的價格區間，這才是目前業界急需解決的難題。
當然，任何一種技術皆有其局限性，虹膜識別亦不例外。首先，虹膜識別的實現對光線有一定的講究，用戶若佩戴眼鏡或者美瞳的話，虹膜的識別與提取會有難度;其次，對虹膜的識別與提取在距離上亦有要求，太遠或者太近皆有影響。
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