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平板劃線分離，在平板培養出單個細菌菌落后可以做鏡檢觀察。
稀釋倒平板法：先把微生物懸液作一系列的稀釋，分別取不同稀釋液少許，與已熔化并冷卻至50℃左右的瓊脂培養基混合，搖勻后傾入滅過菌的培養皿中，待瓊脂凝固后，制成可能含菌的瓊脂平板，保溫培養一定時間即可出現菌落。
如果稀釋得當，在平板表面或瓊脂培養基中就可出現分散的單個菌落，這個菌落可能就是由一個細菌細胞繁殖形成的。隨后挑取該單個菌落，或重復以上操作數次，便可得到純培養。
培養基與菌種分離
培養基與菌種分離是從含有多種微生物的樣品中獲得純種微生物的操作技術。菌種分離主要在培養皿上進行，常用的方法是稀釋法和劃線法。使用這兩種方法的目的是是微生物的一個個體通過繁殖，在固體培養基上長出肉眼能見的群體，根據培養特征，用接種針調取所需菌種并在顯微鏡下檢查，證明為單一形狀的菌體。常用的培養基是選擇培養基。
如分離分解纖維素的微生物用的培養基是以纖維素為碳源的培養基，因為從這種培養基上長出來的只能是分解纖維素的微生物。
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