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(BeWo細胞株*)乳癌和其他癌癥的基因組測序研究

時間:2019/4/22閱讀:802
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(BeWo細胞株*)乳癌和其他癌癥的基因組測序研究

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乳癌中的APOBEC3B表達與細胞增殖密切相關。發現一種缺失多樣性與免疫激活有關。研究揭示了“T細胞受體”是識別人體內正常細胞和病毒的關鍵。

乳癌和其他癌癥的基因組測序研究,已經確定了APOBEC3B (A3B,AID/APOBEC胞苷脫氨酶家族成員)內源性增變基因活性所引起的突變模式。

A3B是一種細胞脫氨酶,在許多腫瘤中是超表達的,被認為是癌癥相關突變的一個重要原因,但是,引起A3B上調的因素仍不明確。此外,還存在一種共同的細胞缺失多樣性(A3Bdel),因此,很大一部分的人群并不表達A3B蛋白。

為了檢測A3B在乳癌中的表達及其結構性缺失的原因和后果,分析了兩大臨床注釋的乳癌數據集——The Cancer Genome Atlas (TCGA) and the molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium (METABRIC),試圖解決這些觀察結果所提出的生物學和臨床問題,主要目的是解決基因表達和多態性關聯之間的不一致性。

研究確認,A3B表達與侵襲性臨床病理特征及預后不良有關,并表明在乳癌和16種其他實體瘤的15種腫瘤中,A3B表達與增殖特征高度相關(有絲分裂和細胞周期相關基因的表達)。

A3B缺失的純合子a3bdel所引起的乳癌患者的這些特征并沒有不同,從而表明A3B表達是增殖增加的一種反映而不是直接原因。利用基因集合富集分析(GSEA),在a3bdel乳癌中檢測到了一種免疫激活模式,似乎與a3bdel攜帶者中出現的突變相關。

這些結果為A3B超表達及其預后影響提供了一個解釋,支持將這個增變基因作為一個癌癥生物標志物或藥物靶點。盡管a3bdel的免疫特征還需要更多的研究,但這些研究結果仍然推薦將a3bdel多態性作為腫瘤免疫治療的一個潛在預測因子。

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