水泡性口炎病毒(VSV)核酸檢測實驗
實驗標本類型:發病動物唾液、水泡液、血清、病毒細胞培養液以及淋巴結等組織;
實驗標本采集:
動物水泡液:無菌條件下水泡液500ul左右,置入1.5ml潔凈EP管。
動物淋巴結等固體組織:無菌條件下取上述組織1g左右,置入1.5ml潔凈EP管。
病毒細胞培養液:取500ul左右,置入1.5ml潔凈EP管。
血清:用5ml注射器無菌條件下取外周血3-5ml,置入5ml潔凈干燥管中。
實驗標本的保存和運輸:上述標本短期內可保存于-20℃,長期保存可置-70℃。但不能超過6個月,標本運送應采用0℃冰壺。
實驗原理:選取一對水泡性口炎病毒(VSV)核蛋白基因保守序列特異性引物和一條特異性熒光探針,應用Trizol提取RNA,經逆轉錄酶作用將RNA轉錄成cDNA,后者在Taq酶作用下,配以FQ-Buffer(內含Mg2+、Tris-HCl等)、四種核苷酸單體(dNTPs)等成分,通過一步PCR-熒光探針體外擴增法對水泡性口炎病毒(VSV)RNA進行擴增,從而達到快速檢測之目的。
實驗目的:適用于檢測動物(豬、馬、驢、牛、羊等)唾液、水泡液、血清、淋巴結等病樣組織標本以及細胞培養液中水泡性口炎病毒(VSV)RNA,適用于水泡性口炎病毒(VSV)感染的輔助診斷及流行病學調查,其檢測結果僅供參考。
實驗樣品處理:
1:固體組織:取50mg左右組織用玻璃勻漿器勻漿或剪刀剪碎,加入500ul RNA提取液A(Trizol reagents),研磨或振蕩至勻漿狀,轉移到1.5ml的EP管中,室溫放置5min。
唾液、水泡液、血清樣品或病毒液:取100ul液體標本加入500μl RNA提取液A(Trizol reagents)充分震蕩,室溫放置5min。
2:加入100ul氯仿,用力震蕩15s,室溫靜置5min,4℃ 13,000rpm離心5min。
3:小心將上層水相轉移到干凈離心管中,加300ul無水乙醇,另加10ul RNA提取液B(內含不溶物,使用前室溫溶解并充分混勻),充分混勻,13,000rpm離心1min。
4:棄上清,加入500ul 75%的DEPC乙醇,充分混勻,13,000rpm離心1min,小心吸去大部分乙醇。
5:將提取管敞口在室溫空氣中干燥5min待乙醇揮發干凈,用20ul DEPC H2O溶解沉淀。
陰性質控品:取100ul陰性質控品加入500μl RNA提取液A(Trizol reagents)充分震蕩,室溫放置5min。后按2-5操作。
VSV-陽性質控品:直接取3μl進行PCR擴增。