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更新時間:2018-11-23 15:53:40瀏覽次數(shù):795次
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魚特定基因序列(Fish)核酸檢測試劑盒費用個標準品的OD值減去空白孔的OD值后作圖,如設置復孔,則應取其平均值計算。以標準品的濃度為橫坐標,OD值為縱坐標,繪出標準曲線。亦可以OD值為橫坐標,標準品的濃度為縱坐標,繪出標準曲線。
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魚特定基因序列(Fish)核酸檢測試劑盒費用1、什么是定量PCR?
以參照物為標準,對PCR終產(chǎn)物進行分析或對PCR過程進行監(jiān)測,從而達到評估樣本中靶基因的拷貝數(shù),稱為定量PCR。定量PCR的可行性定量一般是在PCR擴增的指數(shù)期進行的。
2、定量PCR定量的理論依據(jù)是什么?
特定的待擴增基因片段起始含量越大,則指數(shù)擴增過程越短,當擴增速率趨于穩(wěn)定后,則無論原來樣品中起始模板含量多少,終擴增片段的含量通常是一樣的。
理想的擴增結果:Y=X×2n 其中Y代表擴增產(chǎn)物量, X代表PCR反應體中的原始模板數(shù) n為擴增次數(shù);理論上PCR擴增效率為*,PCR產(chǎn)物隨著循環(huán)的進行成指數(shù)增長,但實際上:DNA的每一次復制都不*,即每一次擴增中,模板不是呈2的倍增長;實際應為:Y= X(1+E)n ,其中E 代表擴增效率:E = 參與復制的模板/總模板,通常E≤1,E在整個PCR擴增過程中不是固定不變的。通常X 在 1~105拷貝、循環(huán)次數(shù)n≤30時,E 相對穩(wěn)定,原始模板以相對固定的指數(shù)形式增加,適合定量分析,這也就是所謂的指數(shù)期;隨著循環(huán)次數(shù)n的增加(>30次),E值逐漸減少,Y 呈非固定的指數(shù)形式增加,后進入平臺期。
3、熒光定量PCR定量的理論模式又是什么?
PCR是對原始待測模板核酸的一個擴增過程,任何干擾PCR指數(shù)擴增的因素都會影響擴增產(chǎn)物的量,使得PCR擴增終產(chǎn)物的數(shù)量與原始模板數(shù)量之間沒有一個固定的比例關系,通過檢測擴增終產(chǎn)物很難對原始模板進行準確定量。近年來研究人員通過大量的實踐,研究了相對準確的定量PCR方法,即熒光定量PCR。
PCR擴增通式: ① Tn=T0(1+E)n
② Tn=Tn-1(1+E)n 注:[0
其中E表示擴增效率,n為循環(huán)數(shù),Tn表示在n個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,Tn-1表示在n-1個周期后PCR產(chǎn)物的數(shù)量,T0為原始模板數(shù)量。設定PCR到達指數(shù)擴增期時,產(chǎn)生一定的熒光(熒光依賴于某一循環(huán)擴增產(chǎn)物的總量,即特定的拷貝數(shù)K,為常數(shù),大約在1010左右)高于背景為儀器所識別,此時的循環(huán)數(shù)為CP(crossing point),也就是K= T0(1+E)CP,取對數(shù)即:
lg K=lg T0+CP*lg(1+E)
CP=- 1/lg(1+E)*lg T0 +lgk/lg(1+E)
由于對一特定的PCR而言,E與K均為常數(shù),故上式為循環(huán)數(shù)(CP)對原始模板拷貝數(shù)的對數(shù)(lg T0)一次方程,其標準形式y=kx+b,該直線的斜率為- 1/lg(1+E),在橫坐標上的截距為lgk/lg(1+E),也是熒光定量PCR所謂的標準曲線。例如下圖為單管實時熒光定量RT-PCR的標準曲線:
魚特定基因序列(Fish)核酸檢測試劑盒費用目前熒光定量PCR均采用外標定量
外標法定量PCR擴增效率的計算,由于標準曲線的斜率(Slope)為- 1/lg(1+E),可知E=10-1/Slope-1 ,如從標準曲線中知道Slope=-3.337,則可推知擴增效率E=101/3。337-1=0.99,也有作者將(1+E)直接視為擴增效率E,則E=10-1/Slope,求得的E值均在1—2之間,有時也有大于2的結果,如下圖所示。另外也可直接根據(jù)系列稀釋外標在該次實時熒光PCR的結果來大略分析擴增效率的高低,例如系列10倍稀釋外標在PCR擴增時有N2=N0En2, N3=(10*N0)En3,在擴增到指數(shù)期時熒光值相同則代表此點的終末拷貝數(shù)相同,即N2=N3,En2-n3=10,取對數(shù)得到⊿ngE=1, E=101/⊿n,E=2,⊿n=3.32; E=1.8,⊿n=3.91.反之亦然。
根據(jù)PCR擴增過程中是否加入某種標記物、標記物的種類以及后檢測的信號的不同可分為四種類型:①直接定量檢測法, ②同位素標記定量,③酶標記定量檢測法,④熒光定量PCR技術
熒光定量PCR 主要原理發(fā)射波長與受體熒光染料光染料吸收供體熒光傳遞的能量而激發(fā)出另一波長的熒光,同時將供體熒光淬滅。SYBR Green I 檢測模式
SYBR Green I 是一種能與雙鏈DNA 結合發(fā)光的熒光大增強。因此, SYBR Green I的檢測出PCR體系存在的雙鏈DNA數(shù)量。SYBR Green I 的大吸收波長約為497nm,發(fā)射波長大約為520nm。PCR擴增程序一般為94℃~55℃~72℃三步法,40個循環(huán)。
SYBR Green I 的缺點:由于SYBR Green I沒有特異性,不能識別特定的雙鏈,只要是雙鏈就會結合發(fā)光,對PCR反應中的非特異性擴增或引物二聚體也會產(chǎn)生熒光,通常本所以在臨床上使用可能會有假陽性發(fā)生。 SYBR Green I的優(yōu)點:SYBR Green I的優(yōu)點是因為其缺點產(chǎn)生,由于它能所有的雙鏈DNA相結合,所以對不同模板不需特別定制不同的這對科研是很有利的,因此國內(nèi)外在科研中使用比較普遍。
5、為什么要用熒光定量PCR技術進行定量?它與傳統(tǒng)的定量PCR有什么不同?
如前所述的,傳統(tǒng)的定量PCR有很多,主要是倍比稀釋法、內(nèi)參照法、競爭法、PCR-ELISA法,但這些定量PCR技術的難點主要在于:(1)如何確定PCR正處于線性擴增范圍內(nèi)(只有在此范圍內(nèi)PCR產(chǎn)物信號才與初始模板的拷貝數(shù)成比例)。(2)一旦線性擴增范圍確定以后,如何找到一個合適的方法檢測結果。為了保證線性,研究者要擴增一系列梯度稀釋的cDNA或者對每個基因的擴增循環(huán)數(shù)作適當?shù)恼{(diào)整;有的研究者加一個競爭性模板,有的做限制性的稀釋梯度分析,或者加一個PCR模擬(mimic)反應,即用相似的引物與目標產(chǎn)物共擴增,而擴增產(chǎn)物的檢測通常在跑膠以后通過染料、放射活性或者探針進行檢測。(3)大多數(shù)是終點檢測,即PCR到達平臺期后進行檢測,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復實驗,所得結果有很大差異(如下圖所示),因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量;雖然加入內(nèi)標后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法,所以傳統(tǒng)定量PCR的缺點是:勞動強度大、定量不準確、重復性差。
豨薟草(豨薟) Herba Siegesbeckiae(Herba Siegesbeckiae) 2g
染料木苷Gqnistqin29-29-9HPLC≥98%,20mg/vial
2×GoldTaq PCR MasterMix 2×GoldTaq PCR MasterMix 暫不提供 暫不提供 1ml,3ml
*71963-77-4Aem
山梔子苷B Gardenoside 24512-62-7 20mg HPLC≥98% 用于含量測定
鹽酸半胱安酸 Cysteine xy7nochloride 100mg
五味子速SchiscndrinB6181-37-620mg
五味子醇乙 Schisandrol B 58546-54-6 20mg HPLC≥98% 用于含量測定
對照品*140700-200401鑒別
* Indirubin 479-41-4 20mg HPLC≥98% 用于含量測定
59432-60-9 蔗果五糖標準品(NA) 20mg
環(huán)皇芪醇Cycloasagenol84602-18-2HPLC≥98%,20mg/支
Kazinol B 小構樹醇 B 99624-27-8
標準品 CAS號: 250mg
北美芹素 13161-75-6 HPLC≥98%;20mg 訂購|咨詢
PYGBrothMediumBase 進口分裝 1,2,4-三(Standard for GC,≥99.5%(GC)) 1,2,4-Tri CAS號: 95-63-6 質(zhì)量規(guī)格: Standard for GC,≥99.5%(GC)
吖啶黃素5mg*5添加于200mlHB160中制成LB2 進口分裝 鄰(標準品) O-Chloro CAS號: 95-49-8 質(zhì)量規(guī)格: 分析標準品,≥99.8%(GC)
FB2添加劑2ml*20支每套添加于100mlHB4193中 進口分裝 滅幼脲標準溶液(100μg/ml,u=4%,基質(zhì):丙) Chlorbenzuron solution CAS號: 57160-47-1 質(zhì)量規(guī)格: 100μg/ml,u=4%,基質(zhì):丙
RaKa-Ray培養(yǎng)基 進口分裝 硒標準溶液(100mg/L,溶劑:水) Selenium standard CAS號: 7782-49-2 質(zhì)量規(guī)格: 100mg/L,溶劑:水
大鼠大內(nèi)皮素(BigET)ELISAKit 進口分裝 白綿馬素AA A0542 3570-40-9 HPLC≥98% 20mg/支
大鼠神經(jīng)營養(yǎng)因子4(NT-4)ELISAKit 進口分裝 番瀉苷元B A0583 517-44-2 HPLC≥98% 20mg/支
豚鼠免疫球蛋白G(IgG)ELISAKit 進口分裝 原堿 A0614 130-86-9 HPLC≥98% 20mg/支
豚鼠晚期糖基化終末產(chǎn)物(AGEs)ELISAKit 進口分裝
魚特定基因序列(Fish)核酸檢測試劑盒費用胎球蛋白-A 進口分裝 阿曲汀 英文名稱: Achty CAS號: 55079-83-9 分子式: 326.43 分子量: C21H26O3
酸性成纖維生長因子 進口分裝 * 英文名稱: Crotamiton CAS號: 483-63-6 分子式: 203.28 分子量: C13H17NO
堿性成纖維生長因子 進口分裝 * 英文名稱: Gemifibrozil CAS號: 25812-30-0 分子式: 250.33 分子量: C15H22O3
成纖維生長因子-4 進口分裝 * 英文名稱: Nizatidine CAS號: 76963-41-2 分子式: 331.46 分子量: C12H21N5O2S2
魚特定基因序列(Fish)核酸檢測試劑盒費用PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;剛開始時, 探針結合在DNA任意一條單鏈上;PCR擴增時,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步。
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