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全基因組重測序技術(WGS)

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更新時間:2019-11-21 20:03:05瀏覽次數:2371次

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產品簡介

全基因組重測序技術(WGS)是在已有參考序列及其基因功能注釋的基礎上,對相關基因組進行重測序,尋找不同個體或處理后相對于參考基因組的差異。該技術可應用于檢測各種遺傳突變,如單核苷酸多態性SNP、體細胞突變SNV,拷貝數變異CNV等,已經成為動植物育種、群體進化、藥物研發、疾病研究和臨床診斷中較為迅速而有效的方法之一,為篩選疾病的致病和易感基因,研究發病及遺傳機制提供重要信息。

詳細介紹

全基因組重測序技術(WGS)是在已有參考序列及其基因功能注釋的基礎上,對相關基因組進行重測序,尋找不同個體或處理后相對于參考基因組的差異。該技術可應用于檢測各種遺傳突變,如單核苷酸多態性SNP、體細胞突變SNV,拷貝數變異CNV等,已經成為動植物育種、群體進化、藥物研發、疾病研究和臨床診斷中較為迅速而有效的方法之一,為篩選疾病的致病和易感基因,研究發病及遺傳機制提供重要信息。

全基因組重測序技術(WGS)數據解讀分析內容:

  1. 標準信息分析
    • 去除接頭序列、低質量序列得到clean data
    • 比對,并統計
    • *性序列生成
    • SNP檢測、注釋及統計
  2. InDel 檢測、注釋及統計
    • SV檢測、注釋及統計
    • CNV檢測、注釋及統計
    • 根據已有數據庫的信息對表型或疾病風險進行評估
  3. 癌癥研究的高級信息分析
    • 成對的樣本(normal-tumor)SNP/InDel/SV/SNV/CNV檢測、注釋及統計
    • 氨基酸置換預測
    • Pathway,GO富集分析
    • 篩選出的突變與已有數據庫比較(cosmic, dbSNP, HGMD等)
    • 重排檢測及注釋
    • 選擇壓力檢測以識別出driver gene
    • Mutation target network

樣本要求:

  1. 樣品類型:無降解,無污染的DNA樣品;
  2. 樣品需求量:≥2μg;
  3.  樣品濃度:≥50 ng/μl;
  4. 樣品純度:OD260/280=1.8~2.0


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