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易錯PCR

時間:2016/1/11閱讀:1879
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    用熱穩定DNA聚合酶擴增目的DNA時.會以一定的頻率發生堿基錯配。這對高保真要求的DNA擴增來說當然是不利的,但這一現象恰好也提供了一種對特定基因進行隨機誘變的可能方法。這種利用PCR過程中出現的堿基錯配對特定基因進行隨機誘變的技術就稱為易錯PCR(error—prone PCR,EP—PCR)。ELISA試劑盒

    在PCR技術發展初期,人們就已經注意到它的易錯本性。但是,如果想將這種易錯本性用于創造突變基因,即便是保真度zui低的TaqDNA聚合酶,在常規的PCR反應條件下,其DNA復制的程度還是太高。

    為了降低PCR中DNA復制的度,研究者想出了多種辦法。其中zui直接也是zui常用的方法是在Taq DNA聚合酶催化的PCR反應體系中加入一定量的Mn 2+(替代天然的輔助因子Mg 2+ ),并同時使反應體系中各種dNTP的比例失衡(通常是將其中的一種dNTP降至5%~10%)。這樣,由于TaqDNA聚合酶缺乏校對活性,其錯配率會大大增加,通常可以達到每千堿基對1個突變左右。另外,還可以加入dITP等脫氧核苷三磷酸類似物來控制錯配水平,采用這種方法可以將錯配率提高到zui高達每5個堿基對1個突變。當然,錯配率并不是越高越好,一般認為,理想的突變頻率為每個基因1.5~5個點突變。

    從易錯PCR的操作過程可以看到,易錯 PCR與傳統誘變育種技術的zui大差別在于,前者是基因水平上的隨機誘變,而后者則是細胞水平上的隨機誘變。而且易錯PCR一般只產生點突變,因此它產生的突變體在多樣性方面尚有一定缺陷。但作為一種能夠從單一基因產生豐富的隨機突變體的技術,仍得到了廣泛的應用。ELISA試劑盒

    有時經一次突變的基因很難獲得滿意的結果.因此又發展了連續策略,通過連續幾代的隨機突變和篩選積累氨基酸突變,成功地提高酶在非自然環境中活性和對非天然底物的活性。K.Chen等人應用隨機突變以提高枯草桿菌蛋白酶E在非自然環境——高濃度有機溶劑二甲基甲酰胺(DMF)中的活力。通過連續多輪突變后,篩選得到突變體PC3。PC3與野生酶相比,在60%二甲基甲酰胺溶液中對多肽底物的水解活性提高了256倍。同時,帶有不同的氨基酸置換組合的枯草桿菌蛋白酶PC3和其他突變體在二甲基甲酰胺和其他有機溶劑中能有效地催化轉酯作用和肽鏈的合成。ELISA試劑盒

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