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逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng) (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR) 的原理是:提取組織或細(xì)胞中的總 RNA,以其中的 mRNA 作為模板,采用 Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成 cDNA。再以 cDNA 為模板進(jìn)行 PCR 擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達(dá)。
實驗步驟:
一、總 RNA 的提取
按照總 RNA 提取實驗步驟提取組織或細(xì)胞中的總 RNA。
二、cDNA 第一鏈的合成
目前試劑公司有多種 cDNA 第一鏈試劑盒出售,其原理基本相同,但操作步驟不一。現(xiàn)以 GIBICOL 公司提供的 SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 試劑盒為例。
在 0.5 ml 微量離心管中,加入總 RNA 1~5 μg,補充適量的 DEPC H2O 使總體積達(dá) 11 μl。在管中加 10 μM Oligo(dT)12~18 1 μl,輕輕混勻、離心;
70℃ 加熱 10 min,立即將微量離心管插入冰浴中至少 1 min;
取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列試劑:第一鏈 cDNA 2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl。輕輕混勻,離心。42℃ 孵育 2~5 min;
加入 SuperscriptⅡ1 μl ,在 42℃ 水浴中孵育 50 min;
于 70℃ 加熱 15 min 以終止反應(yīng);
將管插入冰中,加入 RNase H 1 μl,37 ℃ 孵育 20 min,降解殘留的 RNA。-20 ℃ 保存?zhèn)溆谩?br/>
三、PCR
取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列試劑:第一鏈 cDNA 2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl;
加入適量的 ddH2O,使總體積達(dá) 50 μl。輕輕混勻,離心;
設(shè)定 PCR 程序。在適當(dāng)?shù)臏囟葏?shù)下擴增 28~32 個循環(huán)。為了保證實驗結(jié)果的可靠與準(zhǔn)確,可在 PCR 擴增目的基因時,加入一對內(nèi)參(如 G3PD)的特異性引物,同時擴增內(nèi)參 DNA,作為對照;
電泳鑒定:行瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察結(jié)果;
密度掃描、結(jié)果分析:采用凝膠圖像分析系統(tǒng),對電泳條帶進(jìn)行密度掃描。
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