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如何查找特定基因序列的心得與大家共享,下面以小鼠EDNRB基因為例子說明:
1. 查找一個基因的啟動子之前,是要對這個基因做一個初步的了解
注意:在research下面選擇 Gene 在for后面輸入ednrb
2. 這個是查找結果,由于很多哺乳類動物都有該基因,查找結果顯示了很多五種的ednrb基因,我們選擇其中的Mus musculus 這個是我們要找的小鼠種類,請大家正確選擇自己目標基因的動物種類,Rattus norvegicus是大鼠的學名,Mus musculus是小鼠的學名,由于我的目標是小數的ednrb基因,故選擇Mus musculus。
3: 對Official Symbol Ednrb and Name: endothelin receptor type B [Mus musculus]
Other Aliases: AU022549, ET-B, ET>B<, ETb, Sox10m1, s
Other Designations: piebald
Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM
Annotation: Chromosome 14, NC_000080.5 (104213843..104242913, complement)
GeneID: 13618
解釋:Official Symbol Ednrb and Name 這個是官fang對這個基因的全稱,也就是內皮素受體B 這個是該基因編碼的蛋白質名稱
Other Aliases 該基因的別名
Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM 說明該基因位于第14條染色體上面
Annotation: Chromosome 14, NC_000080.5 (104213843..104242913, complement)
GeneID: 13618
這個說明基因的堿基分布是104213843到104242913.
4. 該基因的具體信息
5. 以上部分是找到對該基因的基本信息,在下面Reference assembly (C57BL/6J)上面找到基因具體序列的鏈接,點擊其中的GenBank, ednrb基因堿基的排列就出來了,這里說明 一下,genbank上面給的序列都是與相應mRNA互補的序列,也就是模板鏈的序列,也就是-(minus strand) 上面的C57BL/6J是得出該序列的小
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