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內源性干擾因素，包括類風濕因子、補體、高濃度的非特異免疫球蛋白、異嗜性抗體、某些自身抗體等。
1、類風濕因子在類風濕患者及正常人血清中，常含有較高或不同濃度的類風濕因子(RF)，其一般為IgM型，亦有IgG和IgA型，具有與變性IgG產生非特異結合的特點，因為在ELISA測定中，其可與固相上包被的特異抗體IgG以及隨后加入的酶標的特異抗體IgG結合，從而出現假陽性結果。避免其發生的方法有：①用F(ab)2替代完整的IgG。②標本用聯有熱變性IgG的固相吸附劑處理。③檢測抗原時，可用2-巰基yi醇加入到標本稀釋液中使RF降解。
2、補體在固相酶免疫測定中，來自哺乳動物的固相抗體和酶標二抗均有激活人補體系統的功能。一方面，固相抗體和酶標二抗可因其吸附及結合過程中抗體分子發生變構，使Fc段的補體C1q結合點暴露出來，使C1q成為一個中介物將二者交聯起來出現假陽性結果。另一方面，固相抗體也會因為活化補體的結合，封閉抗體和抗原的表位結合能力而引起假陰性。解決的辦法是：①用EDTA稀釋標本。②56℃ 30 min加熱血清使C1q滅活。
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